Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms