Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms