Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms