Protein–RNA interactions for Protein: Q96SA4

SERINC2, Serine incorporator 2, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2Q96SA4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SERINC2Q96SA4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms