Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFT140Q96RY7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT140Q96RY7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms