Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms