Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms