Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms