Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTV1Q96GA3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms