Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TM4SF19Q96DZ7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms