Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX21Q969T3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms