Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 TP53-206ENST00000455263 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 TP53-219ENST00000610538 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 TSNAXIP1-206ENST00000561639 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 WDR20-201ENST00000299135 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 AL590438.1-201ENST00000607061 3461 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 AC005225.3-201ENST00000555972 519 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 DICER1-AS1-203ENST00000439999 2323 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 AL035530.2-201ENST00000607391 1675 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 RASGRP4-203ENST00000433821 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 ADGRE3-205ENST00000599900 2099 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 CYP4F35P-201ENST00000582957 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SVIPQ8NHG7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 RBM26-AS1-202ENST00000606049 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LILRB1-205ENST00000396331 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AP5M1-202ENST00000431972 1815 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 Metazoa_SRP.58-201ENST00000618720 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SVIPQ8NHG7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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