Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms