Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms