Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms