Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP43Q70EL4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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