Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC1Q6VVB1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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