Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms