Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LMBR1LQ6UX01 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMBR1LQ6UX01 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms