Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDE2Q6IQ49 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms