Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD40Q6AI12 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms