Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms