Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP170Q5SW79 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms