Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC27A3Q5K4L6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC27A3Q5K4L6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms