Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms