Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN2Q52LD8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms