Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEACAM16Q2WEN9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms