Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDO1Q16878 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms