Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CA9Q16790 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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CA9Q16790 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CA9Q16790 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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