Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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