Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms