Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPEGQ15772 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms