Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC1A5Q15758 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms