Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCOLCEQ15113 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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