Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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