Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LAPTM4AQ15012 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LAPTM4AQ15012 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LAPTM4AQ15012 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LAPTM4AQ15012 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LAPTM4AQ15012 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LAPTM4AQ15012 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAPTM4AQ15012 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAPTM4AQ15012 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAPTM4AQ15012 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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