Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FRMPD4Q14CM0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FRMPD4Q14CM0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms