Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SMCO1Q147U7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SMCO1Q147U7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SMCO1Q147U7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SMCO1Q147U7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SMCO1Q147U7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SMCO1Q147U7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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