Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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