Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IHHQ14623 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IHHQ14623 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IHHQ14623 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IHHQ14623 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IHHQ14623 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms