Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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HNF4GQ14541 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HNF4GQ14541 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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