Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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BECN1Q14457 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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BECN1Q14457 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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BECN1Q14457 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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BECN1Q14457 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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BECN1Q14457 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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BECN1Q14457 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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