Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOFQ13790 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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APOFQ13790 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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APOFQ13790 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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APOFQ13790 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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APOFQ13790 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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APOFQ13790 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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