Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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TUBA3CQ13748 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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TUBA3CQ13748 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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TUBA3CQ13748 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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TUBA3CQ13748 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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TUBA3CQ13748 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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TUBA3CQ13748 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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TUBA3CQ13748 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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TUBA3CQ13748 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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TUBA3CQ13748 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3CQ13748 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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