Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FHL3Q13643 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FHL3Q13643 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms