Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HTR4Q13639 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HTR4Q13639 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms