Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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