Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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