Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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ITGB3BPQ13352 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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