Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SP140Q13342 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP140Q13342 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP140Q13342 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SP140Q13342 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SP140Q13342 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SP140Q13342 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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